Proses pembentukan lapisan tipis ini berlangsung selama beberapa waktu dan membutuhkan energi yang besar dari kerang. Ketika benda asing sudah terbungkus oleh lapisan-lapisan tipis ini, maka terbentuklah nukleus mutiara.
Tahap Kedua: Pengeluaran Lapisan Perlindungan
Setelah terjadi gangguan pada kerang, selanjutnya terjadi sebuah proses di mana kerang akan mengeluarkan lapisan perlindungan sebagai respons terhadap iritasi tersebut. Lapisan perlindungan ini kemudian akan terus dikeluarkan dan diperkuat oleh kerang selama beberapa waktu hingga akhirnya membentuk sebuah mutiara yang indah.
Proses pengeluaran lapisan perlindungan ini terjadi karena di dalam kerang terdapat zat yang disebut dengan nacre atau mother-of-pearl. Zat ini merupakan senyawa organik dan anorganik yang berbentuk lembaran-lembaran seperti bata yang saling menumpuk dan saling melekat satu sama lain.
Ketika terjadi iritasi pada kerang, zat nacre diproduksi dan dikeluarkan secara berlebihan. Lapisan nacre yang terus bertambah akan membentuk sebuah bola kecil yang akhirnya akan menjadi mutiara.